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Q1:使用植物叶片作为样本时如何处理样品?
A1:推荐使用50μl反应体系并使用直径大小为0.5-3mm的幼嫩叶片。较小反应体系和过多的叶片使用量容易导致扩增失败。
Q2:使用植物粗品作为样本时如何处理样品?
A2:可通过调整粗品处理方式和使用量来获得更优扩增效果。可尝试将Plant Direct Lysis Buffer A中的样本捣碎后于室温孵育3min;将加入的模板在0.5-5μl之间调整,或将粗品按1:1-1:10的比例进行稀释后,取1μl作为模板;需注意的是,植物样本和粗品中存在PCR反应抑制成分,加入过多模板容易一致反应导致扩增失败。对于难以扩增的样本,可尝试在Plant Direct Lysis Buffer A中加入终浓度为2%的β-巯基乙醇或10mM的DTT。
Q3:无产物或产物量少。
A3:(1) 核对引物设计,确认引物的纯度和浓度。
(2) 重复实验,确认反应体系配制、反应程序设置无误。
(3) 增加循环数,或延长延伸时间。
(4) 提高Mg2+ 浓度。
(5) 设置退火温度梯度,找到合适的退火温度。
(6) 尝试不同的模板用量,增大反应体积或尝试使用BME/DTT。
Q4:有杂带或弥散条带。
A4:(1) 优化引物设计,降低引物浓度。
(2) 尝试提高退火温度或设置退火温度梯度,减少退火时间。
(3) 减少总循环数,延长时间不超过60sec/kb。
(4) 尝试不同的模板用量,增大反应体积或尝试使用BME/DTT。